Я уведомлял в 2016м году, в 2017 налоговая меня попросила отчитаться, я выслал им скан загранпаспорта с штампами. По штампам я был за пределами Росии более 183 дней. Налоговая извинилась. Все общение с налоговой - через личный кабинет на nalog.ru.
В добавок вы ещё должны уведомить ФМС о наличии у вас ВНЖ, это делается лично иил через почту.